工程合同欠款纠纷管辖的确定需要根据具体情况分析。1、工程合同中约定了管辖的，则按照约定处理。2、工程合同中未约定管辖的，可以根据民事诉讼法的规定，一般为被告住所地或者合同履行地人民。风险提示：合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民管辖，但不得违反对级别管辖和专属管辖的规定。
法律依据
《民事诉讼法》第二十三条